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导读
胰腺导管腺癌(pancreatic ductal denocarcinoma, PDAC)是最致命的癌症之一,其五年生存率仅为13%。PDAC缺乏有效治疗的主要原因是肿瘤微环境间质压高、血管稀少和营养缺失。为适应此营养匮乏的微环境,PDAC细胞依赖溶酶体途径,通过表达高亲和力营养转运蛋白、大量吞噬以及与其他细胞相互作用等手段来获取非常规的营养物质。研究报道,靶向自噬和溶酶体依赖性途径能破坏PDAC代谢,但是缺乏有效且具体的靶点。
脂质激酶PIKfyve能催化磷脂酰肌醇3,5-二磷酸(PtdIns (3,5) P2)和磷脂酰肌醇5-磷酸(PtdIns5P),在溶酶体途径中发挥重要的调控作用。目前,两种PIKfyve抑制剂apilimod和ESK981已通过1期临床试验,提示靶向PIKfyve具有巨大的转化潜力。
近日,来自美国密歇根大学的研究团队在Nature上发表了题为“Targeting PIKfyve-driven lipid metabolism in pancreatic cancer”的研究报告。研究发现,抑制PIKfyve会迫使PDAC依赖脂质从头合成以获取能量,从而遏制PDAC发展,而联合抑制KRAS-MAPK(kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog,mitogen-activated protein kinase)通路能够阻断脂质从头合成,有效清除PDAC。这种双重靶向脂质稳态的策略有望成为PDAC极具前景且可快速转化的新疗法。
表型:PIKfyve抑制剂显著抑制胰腺癌进展
为探究PIKfyve在胰腺癌发展中的作用,本研究:
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利用RNA原位杂交自发技术发现,癌变组织部位中PIKfyve呈高表达。
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通过构建胰腺腺泡细胞(Ptf1a-Cre)特异性敲除PIKfyve的转基因小鼠,发现在健康小鼠中敲除PIKfyve不影响胰腺的发育和功能。然而,在KPC模型中敲除PIKfyve或使用PIKfyve抑制剂(ESK981),均可显著延长小鼠生存时间,并抑制肿瘤进展。
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在皮下同种异体移植瘤模型和异种移植瘤模型中,ESK981均表现出良好的抗肿瘤活性,显著抑制了肿瘤生长,并降低了肿瘤负荷。
上述结果表明:胰腺在健康状态下不需要PIKfyve,但在PDAC发病时,抑制PIKfyve能有效抑制肿瘤进展。
机制:抑制PIKfyve降低溶酶体自噬功能并诱导脂肪酸从头合成
(1)PIKfyve调控PDAC进展的分子机制
本研究分别采用基因敲除PIKfyve、使用PIKfyve抑制剂(apilimod、ESK981)或靶向降解剂(PIK5-33d)处理不同胰腺癌细胞,发现细胞出现自噬通量降低,增殖活性减弱以及细胞空泡化。虽然自噬抑制剂氯喹也能产生类似效果,但PIKfyve抑制显示出更强的杀伤活性。
基于溶酶体(包括自噬)在维持铁稳态和促进线粒体呼吸中的作用,研究团队进一步探究PIKfyve抑制是否通过类似的机制抑制细胞生长。结果发现,PIKfyve抑制并未降低氧耗率,其抗增殖作用也无法被铁补充所逆转,表明PIKfyve抑制不依赖铁稳态或线粒体呼吸来发挥其抑制肿瘤的作用。
(2)评估PIKfyve在代谢中的调控作用
本研究对MIA PaCa-2细胞进行了两轮平行CRISPR筛选(高/低剂量PIKfyve抑制),聚焦于代谢相关基因。结果显示,PIKfyve抑制导致脂质合成通路基因的显著耗竭:高剂量抑制靶向胆固醇合成、脂肪酸从头合成与延伸、鞘脂合成和线粒体代谢;低剂量抑制靶向脂肪酸合成与延伸,同时编码脂质β-氧化第一步限速酶ACOX1的sgRNA在两种剂量筛选中均被强烈富集。
本研究进一步使用CRISPRi技术或小分子化合物特异性抑制脂质合成通路关键蛋白的活性,发现均能增加细胞对PIKfyve抑制剂的敏感性。综上表明,PIKfyve抑制后,细胞自噬通量降低并诱导细胞通过增强脂质分解(β-氧化)来补偿脂质合成阻断引发的代谢危机。
(3)PIKfyve抑制后PDAC细胞的组学分析
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转录组分析显示,上调基因主要富集于胆固醇稳态、mTORC1信号通路以及脂肪酸代谢等代谢相关通路。其中,典型SREBP1靶基因和SREBP1表达升高,而SREBP阻断剂可部分逆转上述效应,这提示SREBP在PIKfyve调控脂质代谢中发挥重要作用。
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代谢组分析显示,抑制PIKfyve后,细胞呈现与转录组相似的代谢谱变化。
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靶向脂质组分析显示,PIKfyve抑制诱导脂质组成发生显著改变,且这些变化部分依赖于SREBP1活性。
鉴于柠檬酸转运体SLC25A1在CRISPR筛选中也被鉴定为关键靶点,本研究提出假设:糖酵解代谢物被用于生成柠檬酸,后者转而分流至从头脂质合成,并且通过U-¹³C₆葡萄糖稳定同位素示踪实验证实该假设。这些数据表明,PIKfyve抑制迫使PDAC细胞将葡萄糖来源的碳流转向新脂质(尤其是鞘脂)的合成。
(4)PIKfyve抑制导致溶酶体膜胆固醇积累,激活SREBP1信号
研究发现,PIKfyve抑制并未干扰AMPK信号通路,且其对SREBP的激活作用不依赖于AMPK。同时,自噬启动因子ULK1抑制、其他溶酶体抑制剂及溶酶体胆固醇转运蛋白NPC1抑制剂,均能激活SREBP1信号。PIKfyve抑制导致溶酶体空泡化和溶酶体膜胆固醇异常积累,而U18666A仅引起胆固醇滞留,不诱发空泡化。值得注意的是,溶酶体膜胆固醇积累与SREBP激活在4小时即出现,且外源补充固醇可逆转PIKfyve抑制诱导的SREBP激活。
综上表明,PIKfyve抑制破坏脂质稳态的机制独立于AMPK信号与自噬流,其通过引起溶酶体空泡化和功能障碍,导致脂质(尤其是胆固醇)滞留在溶酶体膜,进而迫使细胞依赖脂质从头合成以维持生存。
治疗:双重抑制PIKfyve与KRAS-MAPK通路实现协同抗癌
既往研究报道,KRAS-MAPK信号转导驱动脂肪酸从头合成。与之一致,本研究发现抑制KRAS-MAPK信号转导可抑制脂肪酸从头合成途径。基于此,本研究进一步探究了联合抑制PIKfyve和KRAS-MAPK通路是否能协同阻断脂质合成,进而抑制肿瘤进展。实验结果显示:
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单用PIKfyve抑制剂会促进脂肪酸从头合成关键酶(FASN/ACC1)表达上调,但联合KRAS失活后,该上调效应被显著抑制。
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在体外细胞实验中,PIKfyve抑制剂(apilimod/ESK981)与KRAS-MAPK抑制剂(MRTX1133/Trametinib)任意组合均显示出强协同效应,显著降低PDAC细胞的增殖活力。
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在动物模型中,通过三类递进模型(免疫健全的同源原位模型→人源PDX模型→自发成瘤KPC模型)进一步发现了双重抑制对肿瘤的杀伤作用,具体而言:几乎完全清除肿瘤,中位生存期延长超过5倍,消除肿瘤效果显著且优于单药治疗。
以上实验结果充分验证了治疗策略的转化潜力,为后续临床试验奠定基石。
图1:单PIKfyve抑制作用以及协同KRAS-MAPK双重抑制作用
图源:Nature原文
研究总结
本研究证实PIKfyve是破坏PDAC溶酶体功能的治疗靶点,并详细阐明了其作用机制,同时发现联合抑制PIKfyve与KRAS-MAPK通路可显著消除PDAC肿瘤负荷。
PIKfyve是维持溶酶体依赖性脂质稳态的必要调节因子,而KRAS-MAPK信号驱动PDAC细胞的从头脂质合成;PIKfyve抑制导致溶酶体脂质代谢紊乱,迫使PDAC细胞上调并依赖从头脂质合成;双重抑制PIKfyve与KRAS-MAPK使PDAC细胞因无法获取功能性脂质而陷入代谢危机。
鉴于突变型KRAS抑制剂、泛KRAS抑制剂、MAPK通路抑制剂及PIKfyve抑制剂ESK981的快速发展,PIKfyve与KRAS-MAPK抑制剂的联合使用,将有望成为治疗PDAC极具前景且具备快速转化潜力的治疗策略。
引证本文
Cheng, C., Hu, J., Mannan, R. et al. Targeting PIKfyve-driven lipid metabolism in pancreatic cancer. Nature (2025).
https://doi.org/10.1038/s41586-025-08917-z
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