致病微生物，如病毒与细菌，长期存在于扁桃体表面或隐窝，但人体免疫力正常时，它们并不致病，当免疫力下降时，这些致病微生物就会活跃起来，从而引起感染。

而诱发扁桃体急性炎症的因素主要是受凉后感冒引起。在疲劳过度、烟酒过多、刺激性食物、妇女月经期、有毒害气体刺激等情况时，容易引起扁桃体炎的发生。