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深度解析医学证据,lxfs.net为你支撑决策 剪接破坏型变异约占所有致病变体的三分之一,然而由于传统检测手段对非经典剪接位点的局限,这类变异在临床数据库中常常被低估。短读长RNA测序已在临床实践中成为弥补这一缺陷的有力工具,但其无法生成全长转录本,也难以解析复杂区域和长片段内含子滞留等异常剪接事件。为评估长读长RNA测序的额外价值,研究者采用PacBio平台的Kinnex全长RNA方案,对来自英国和荷兰的25名疑似携带剪接相关变异的罕见病患者进行了长读长RNA测序,并将其表现与短读长数据进行了系统比较。样本来源包括血液和成纤维细胞,部分样本还分别进行了珠蛋白去除和环己酰亚胺处理以抑制无义介导的降解,测序在Revio系统上完成,数据经Read Segmentation、Iso-Seq流程和Pigeon分类过滤后用于后续分析。 在方法层面,短读长RNA测序数据来自既往研究,分别使用STAR和HISAT2比对至GRCh38参考基因组,并以GENCODE v38为注释,基因计数和转录本定量分别由Salmon和Stringtie完成。长读长数据则按批次在PacBio不同中心生成,血液样